SKRINING FITOKIMIA EKSTRAK DAUN DADAP SEREP DAN PREDIKSI INSILICO POTENSI SENYAWA SEBAGAI ANTIBAKTERI

Arief Kusuma Wardani, Herma Fanani Agusta, Alfian Syarifudin, Azmi Rahmadani

Abstract


Pendahuluan: Tanaman dadap serep merupakan tanaman asli Indonesia dan sering digunakan sebagai bahan obat tradisional dan pembuatan banten di Bali. Daun dadap serep telah digunakan di Indonesia sebagai obat rematik, sakit perut, asma, disentri, dermatitis kontak, eksim, dan infeksi kulit [3]. Informasi kandungan bahan aktif tumbuhan obat telah banyak dipublikasikan dalam buku, jurnal nasional maupun internasional [4], diketahui fitokonstituen yang terkandung memiliki bioaktivitas yang beragam seperti antibakteri [5] dan antiinflamasi [6]. Tujuan: Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi senyawa fitokimia dalam ekstrak daun dadap serep menggunakan GC-MS dan LC-MS serta memprediksi potensi antibakterinya melalui pendekatan molecular docking secara in silico. Metode: Daun dadap serep diekstraksi menggunakan etanol 70%, kemudian dianalisis kandungan senyawanya dengan GC-MS dan LC-MS. Delapan senyawa teridentifikasi selanjutnya dilakukan molecular docking terhadap protein target 2QNX (enzim FabH dari Mycobacterium tuberculosis) menggunakan software iGEMDOCK untuk mengevaluasi afinitas dan interaksi molekuler. Hasil: Ekstraksi menghasilkan rendemen 65% dari 120 gram simplisia kering. Analisis GC-MS dan LC-MS berhasil mengidentifikasi delapan senyawa alkaloid. Hasil molecular docking menunjukkan senyawa 2-(6-[1-Ethyl-4-[4-(1h-Pyrrole-2-Carbonyl)-2,3,3a,4,5,7a-Hexahydro-1h-Inden-5-Yl]-Buta-1,3-Dienyl]-5 memiliki afinitas terbaik dengan energi ikatan -181.79 kcal/mol, diikuti 2h-Octahydropyrido[1,2-A]Pyrazin-1-One dengan -176.28 kcal/mol. Kesimpulan: Ekstrak daun dadap serep mengandung senyawa alkaloid yang berpotensi sebagai antibakteri alami berdasarkan prediksi in silico.

Kata Kunci: Erythrina subumbrans, GC-MS, LC-MS, molecular docking, antibakteri


Full Text:

PDF

References


Abdullah D, Febrianto BY, Dewi NP, Vani AT, Ulfah FC. The Effectiveness of 80% Kefir Gel Against the Overview the Number of Fibroblasts in Healing Cuts mice (Mus musculus). J Kesehat Prima. 2022;16(1):18–24.

Menaldi SLSW. Pedoman Nasional Pelayanan Kedokteran Tata Laksana Kusta. 2019;

Himawan F. Gambaran Pertolongan Pertama Luka Bakar Ringan Pengelola Panti Asuhan Kota Tegal pada Bencana Kebakaran. Juru Rawat J Updat Keperawatan. 2022;2(2):60–4.

Riset Kesehatan Dasar (Riskesdas). Laporan Nasional Riskesdas 2018 [Internet]. Lembaga Penerbit Balitbangkes. 2018. hal. hal 156. Tersedia pada: https://repository.badankebijakan.kemkes.go.id/id/eprint/3514/1/Laporan Riskesdas 2018 Nasional.pdf

Mahdani W, Rizal S, Amirsyah M. Evaluasi Kejadian Infeksi pada Pasien Luka Bakar yang Dirawat Inap di RSUD dr. Zainoel Abidin. J Med Sci. 2022;3(2):71–9.

Schcolnik-Cabrera A. Current Approaches to Overcome Antimicrobial Resistance. Curr Med Chem. 2023;30(1):3–4.

Sun W, Shahrajabian MH. Therapeutic Potential of Phenolic Compounds in Medicinal Plants—Natural Nealth Products for Human Health. Molecules. 2023;28(4):1845.

Mugiyanto E, Slamet S, Fatmala R. Karakterisasi Simplisia dan Ekstrak Anti Piretik Daun Dadap Serep (Erythrina Lithosperma Miq) dari Kabupaten Pekalongan. In: Prosiding University Research Colloquium. 2018. hal. 669–74.

Wibowo Y. Penggunaan Erythrina subumbtans sebagai Alternatif Terapi Bendungan ASI pada Ibu Menyusui. J Matern Child Heal. 2020;9(3):187–92.

Noor Kholidha A, Putu Wira Putra Suherman I. Uji Aktivitas Ekstrak Etanol Daun Dadap Serep (Erythrina lithosperma Miq) sebagai Antibakteri terhadap Bakteri Salmonella typhi. Medula. 2016;4(1):281–90.

Arifin SN, Pratiwi D, Setiawan AA. Studi in silico Senyawa Flavonoid Dari Ekstrak Kacang Panjang (Vigna sinensisL.) sebagai Penumbuh Rambut dengan Reseptor Androgen. J Farmagazine. 2017;4(2):31–7.

Hardjono S. Pemodelan Molekul, Sintesis dan Penentuan Aktivitas Antineoplastik 1-(4-Trifluorometilbenzoiloksi) Urea. J Ilmu Kefarmasian Indones. 2017;14(1):62–5.

Makatita FA. Riset In silico dalam Pengembangan Sains di Bidang Pendidikan, Studi Kasus: Analisis Potensi Cendana sebagai Agen Anti-aging. J ABDI (Sosial, Budaya dan Sains). 2020;2(1).

Montero MAM, Wardani AK, others. Studi In silico Senyawa Golongan Flavonoid dari Ranting dan Akar Dadap Serep (Erythrina subumbrans) Sebagai Antipiretik. J Pharm Sci. 2024;86–93.

Masada Y. Analysis of Essential Oils by Gas Chromatography and Mass Spectrometry. 1976;

Brogi S, Ramalho TC, Kuca K, Medina-Franco JL, Valko M. In Silico Methods for Drug Design and Discovery. Vol. 8, Frontiers in chemistry. Frontiers Media SA; 2020. hal. 612.

Khalaf HS, Naglah AM, Al-Omar MA, Moustafa GO, Awad HM, Bakheit AH. Synthesis, Docking, Computational Studies, and Antimicrobial Evaluations of New Dipeptide Derivatives Based on Nicotinoylglycylglycine Hydrazide. Molecules. 2020;25(16):3589.

Kumar D, Meena MK, Kumari K, Patel R, Jayaraj A, Singh P. In-silico Prediction of Novel Drug Target Complex of NSP3 of CHIKV Through Molecular Dynamic Simulation. Heliyon. 2020;6(8).

Richa M, Tita N, Tresna L, others. Molecular Docking of 1-benzoyl-3-methylthiourea as Anti Cancer Candidate and Its Absorption, Distribution, and Toxicity Prediction. J Pharm Sci Res. 2017;9(5):680.

Sachdeva S, Musayev FN, Alhamadsheh MM, Scarsdale JN, Wright HT, Reynolds KA. Separate Entrance and Exit Portals for Ligand Traffic in Mycobacterium tuberculosis FabH. Chem & Biol. 2008;15(4):402–12.

Pratama AB, Herowati R, Ansory HM. Studi Docking Molekuler Senyawa dalam Minyak Atsiri Pala (Myristica fragrans H.) dan Senyawa Turunan Miristisin terhadap Target Terapi Kanker Kulit. Maj Farm. 2021;17(2):233–42.

Atmoko HD, Pangestuti IR, Maulina E, Kusuma TM, Wardani AK, Kaltsum U. In silico Study to Molecular Docking Study Testing the Activity of Clove Flower Essential Oil Components (Syzigium aromaticum (L)) as Anti-breast Cancer on EGFR Receptors. In: AIP Conference Proceedings. 2023.

Brooijmans N. Docking Methods, Ligand Design, and Validating Data Sets in the Structural Genomic Era. Struct Bioinforma. 2009;11(1):635–63.

Tania POA, Listyawati AF, Soekanto A, Simamora D, Purbowati R, others. Studi Invitro dan Insilico Efektivitas Antibakteri Kunyit Putih Terhadap Hambatan Pertumbuhan Escherichia Coli. Indones J Infect Dis. 2024;10(1):47–67.

Purnomo RY. Potensi Antimalaria Senyawa Azadiractin, Gedunin, dan Nimbolide dalam Mengikat PfATP6 dan Menghambat Lactate Dehydrogenase: Studi In Silico. J Bio Komplementer Med. 2019;6(3).

Bintari YR, Damayanti DS. Skrining Potensi Essential Oil Pogostemon Cablin Bent Secara In Silico dalam Penghambatannya terhadap ACE II dan TMPRSS2 sebagai Anti Covid-19. J Kesehat Islam Islam Heal J. 2022;11(2):102–10.




DOI: https://doi.org/10.33085/jdf.v10i1.6600

Refbacks

  • There are currently no refbacks.



Sponsored/Supported by:

                     

Contact Person:

apt.Meiva Amelia Lubis. S.Farm.,M.Farm
Department of Pharmacy, Faculty of Pharmacy, 
Institut Kesehatan Helvetia
Jl. Kapt Sumarsono 107, Helvetia, Medan, Sumatera Utara-20124, Indonesia
Hp: +6287784286161. Tel: (061) 42084606
email: duniafarmasi@helvetia.ac.id
Faks. (061) 42084606Website: https://helvetia.ac.id/.